色盲的病因可以分为色盲可分为先天性色盲和后天性色盲。先天性色盲多为红绿色盲，对于红绿辨色有障碍，红绿色盲也是最常见的色盲。眼睛之所以能辨识颜色，是由于眼睛存在三种能辨色的椎状细胞，这三种椎状细胞分别能吸收不同波长范围的光，分别是蓝、绿、红。当椎状细胞受到损伤或发育不全时，就有可能造成色盲。
色盲是X染色体伴性遗传，而且是隐性遗传。一般认为，红绿色盲决定于X染色体上的两对基因，即红色盲基因和绿色盲基因。由于这两对基因在X染色体上是紧密连锁的，因而常用一个基因符号来表示。红绿色盲的遗传方式是X连锁隐性遗传。男性仅有一条X染色体，因此只需一个色盲基因就表现出色盲。女性有两条X染色体，因此需有一对致病的等位基因，才会表现异常。所以男性的色盲患病率会比女性高。一个正常女性如与一个色盲男性婚配，父亲的色盲基因可随X染色体传给他们的女儿，不能传给儿子。女儿再把父亲传来的色盲基因传给她的儿子，这就是隐性遗传。
